海洋微生物基因宝库:发现新型CRISPR系统、抗菌肽及PET塑料降解酶

华大生命科学研究院等机构的研究团队成功构建全球首个海洋微生物基因数据库

近日,我国科研团队在对海洋微生物宏基因组数据进行深入研究和分析的过程中,取得了重大突破。他们成功构建了迄今为止最为全面的海洋微生物基因数据库——The Global Ocean Microbiome Catalogue(GOMC)。这一数据库包含了超过4.31万个海洋微生物基因组和24.58亿个基因序列,涵盖从南极到北极、从近海到深海等各种海洋生态系统。

海洋微生物宏基因组组装分箱技术是实现这一成果的关键。这种技术能够将环境样本测序得到的大量基因短序列进行拼接、分箱聚类,从而获得完整的基因组。这些基因组被称为“宏基因组组装基因组”(MAGs)。

此次研究还发现了许多具有应用潜力的基因资源,包括新型基因编辑工具、抗菌肽和PET塑料降解酶等。这些发现有望为未来医学、环境保护等领域带来革命性的变革。

据悉,该研究团队的成员来自华大生命科学研究院、山东大学、英国东安格利亚大学、中国海洋大学、厦门大学、丹麦哥本哈根大学等机构。他们利用GOMC数据库,分析了海洋微生物基因组大小变化、遗传免疫机制演化等生态规律,并从中发现了大量能够应用在基因编辑、抗生素以及塑料降解等领域的基因资源。

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